Maîtriser ImageJ pour le traitement des images numériques

Description du poste

Objectifs

A l'issue du stage, les participants seront capables d'implanter et d'exploiter ImageJ comme solution d'analyse et de traitement d'images dans leur environnement de travail habituel.

niveau 1

Personnes concernées

Chercheurs, ingénieurs et techniciens utilisateurs de l'imagerie numérique, dans tous les domaines, biologie, médecine, astronomie, physique, géosciences etc.

Pré-requis

Connaissances de base en informatique.
Utilisation d'images numériques.

Programme

Brefs rappels sur la notion d'image numérique
- Résolution, types et formats d'images
- Rappel sur les méthodes d'acquisition : photos, scans, caméras
ImageJ, un logiciel multiplateforme, libre, gratuit et extensible
- Présentation d'ImageJ
- Installation sur les différentes plateformes Mac OS X, Windows, Unix
- Découverte des différentes fonctions de l'interface graphique
- Fonctions de base : amélioration d'image, débruitage
- Opérations entre images : superposition, moyenne, correction d'illumination, etc.
- Calibration spatiale et de densité
- Détection d'objets, mesures, comptages
Découverte des modalités d'extension du logiciel
- Enregistrement et édition de macro-commandes ou macros
- Installation de modules d'extension ou plugins

Méthodes pédagogiques

Bref diaporama d'introduction, puis prise en main directe du logiciel pour son installation, son utilisation.
Chaque stagiaire dispose d'un poste de travail, de documents papiers et d'un support électronique.

Nature et sanction de la formation

Cette formation constitue une action d'adaptation et de développement des compétences. Elle donne lieu à la délivrance d'une attestation de participation.

Une évaluation en fin de formation permet de mesurer la satisfaction des stagiaires, notamment concernant l'atteinte des objectifs pédagogiques.

Responsable scientifique

Jérôme MUTTERER, Ingénieur de recherche CNRS, Plateforme d'imagerie cellulaire, Institut de Biologie Moléculaire des Plantes, Strasbourg.

Courriel : mutterer@unistra.fr

Durée
2 jours

Lieu

Maison Interuniverisitaire des sciences de l'Homme - Alsace
5 Allée du Généal Rouvillois
67083 STRASBOURG
FRANCE

Frais de participation

Repas de midi pris en charge par les organisateurs.
Code : 295

825.00